Mikatano ワークスに書類を保存すれば、事務処理規程は不要でしょうか？

以下の機能を利用すると、タイムスタンプが付与されます。
そのため、「電子取引データの訂正及び削除の防止に関する請求書のPDFファイルを保存事務処理規程」は不要です。

・Mikatano ワークスのタイムスタンプ付与機能

ただし、ファイル受領後からMikatano ワークスへのアップロード（タイムスタンプの付与）までの期間を「概ね7営業日以内」から延長する場合は、「各事務の処理に関する規程」を定める必要があります。

電子帳簿保存法の「電子取引区分」に関する要件の詳細は、電子帳簿保存法一問一答 【電子取引関係】 問14 | 国税庁をご確認ください。